根据北海道大学官网2015年2月的数据，北海道大学拥有3个国家共用设施，3个附属研究所和20个校内男女同校研究设施。

所属研究所(3):深冷科学研究所、电子科学研究所、遗传病控制研究所

国家共用设施(3):催化化学研究中心，斯拉夫研究中心、信息基础中心校园公共教育研究设施研究设施、同位素合成中心、外语教育中心、量子集成电子学研究中心、阿伊努人与前土著研究中心、北方生物圈野外科学中心、社会科学实验研究中心、创业研究中心、信息法律与政策研究中心、脑科学研究与教育中心环境纳米生物工程研究中心人畜共患病研究中心数学合作研究中心大学图书馆可持续发展教育研究中心旅游高级研究中心拓扑工程教育研究中心医疗保健中心环境健康科学研究教育中心2015年2月北海道大学官网北海道大学有一个“最先进的研究和开发支持项目”(开发可持续的分子示踪放射治疗设备)。

根据2014年3月发布的年度Nature Publishing Index(日本机构排名)报告，北海道大学在2013年期刊0755-799000的优质论文贡献指数中排名第9位。研究论文(日本)CC2Articles31东京大学(UTokyo) 56.11542理化研究所(Science)、32.691223京都大学29.12774大阪大学19.79755东北大学12.99516东京工业大学11.06307九州大学9.99438名古屋大学7.64369北海道大学7.392210 NTT集团6.871111国家先进产业科学技术(Industry)、日本6.22612国立材料科学研究所(净利润)5.832513海洋地球日本科学技术研究所(JAMSTEC)日本5.351614横滨市立大学(YCU) 5.271515筑波大学4.2311截至2011年3月31日，北海道大学附属图书馆藏书380万册，是日本为数不多的学术图书馆之一。图书数量图书馆日语图书西方图书总数附属图书馆9088677406841649551北馆227446102145329591院系等8521359640231816158总198844818068523795300 2015年2月北海道大学官网)展览博物馆综合博物馆

北海道大学综合博物馆收藏了许多世界上最有价值的学术标本和资料。其中包括名为日本龙的大型恐龙化石、英国动物学家布莱基斯顿在本州和北海道收集的255种约1300种鸟类标本、明治时代以来从北极到南极的世界各地的海洋和淡水地区收集的大型鱼类标本。自1876年札幌农业学校成立以来，该博物馆是130多年来研究的宝藏。它还收藏了400多万份学术标本。展示厅设有“北海道大学历史”、“学术主题”、“学术资料”等展览。在三楼的展厅里，陈列着地球与行星科学领域的学术资料和标本(化石、矿物、岩石等)，以及大型哺乳动物化石长毛象。这是一件极为珍贵的学术标本，具有特殊的价值。