一、大量中小河道被填埋

随着城镇化的加快和经济的发展，工业、商业和居住用地不断扩张，导致许多中小河流被缩小甚至填平，使中小河流数量、面积急剧缩减，而且这种情况在一定时期内将长期存在。河流的萎缩致使原有的生物多样性和河道景观被破坏甚至消失，缺失了河流这一重要的生态载体，生态系统变的更加脆弱，而且河道行洪断面的缩减，导致洪涝灾害更加频繁发生。

二、自然地貌被改变，河流功能简单化甚至完全丧失

自然河道受到人类的强烈干预，河流形态几何化现象普遍存在，使得河流景观多样性消失。河流中各种水生动植物对水温、有机物浓度等有着不同的要求和适应能力，由于堤岸采取了硬质化的护岸材料，使得原有的动植物栖息地消失，并且导致水流速度减缓，环境状况恶化，失去了城镇河道本身的景观价值，原有的社会、经济和人文价值也丧失，城镇河道演变成简单的泄洪沟和灌溉沟渠。

三、河道自净功能受损

自然河道具有良好的自净功能，丰富的好氧微生物能快速分解污染物，但重污染河道的水体都处于缺氧或厌氧状态，好氧微生物无法良好的生存，河道自净功能严重受损。并且部分不恰当的水利工程破坏了河流原有的自然净化能力，如大量修建的闸坝使活水变成了死水，人工修建的护坡工程破坏了河道周围天然湿地，降低了河流对污染物的吸附能力和净化能力。

四、 水环境污染严重，生态系统功能退化

一方面，城镇河道水体流动性差，缺水客水，导致被污染的河道无法及时循环更新另一方面，我国众多的中小河流位于乡镇和农村，由于监管的缺失，这些水域往往处于无人管理的状态。随着我国城镇化的快速发展，众多居民区聚集，但排污管网与设施并未配套，污水收集率低，大量的农村生活污水未经任何处理即被排入了河道中，中小河流变成排污沟，另外城镇中小河流多濒临农田，氮磷营养丰富的农业面源污染被肆意排入河道，导致污染加剧，对周围居民的身心健康产生了严重威胁。