海洋微生物主要包括三大类，即原核微生物(如细菌)、真核微生物(如真菌、藻类和原生动物)和非细胞生物(如病毒)，它们在自然界分布广泛，种类繁多。由于其代谢途径的多样性和遗传适应性，它们能够在许多极端环境中生存，并发挥着重要的生态作用，这使它们给人类留下了极其深刻的印象。下面介绍几种海洋微生物。

1. 海洋细菌

海洋细菌是一大类原核微生物。它们不含叶绿素和藻蓝蛋白，只能在海洋中生长和繁殖。它们是最大和分布最广泛的海洋微生物。它们的直径一般小于1微米，呈球形、棒状、螺旋状或分枝丝状，细胞壁坚韧，微弹性，无真核生物。海洋中有自养型和异养型、光养型和化养型、好氧型和厌氧型、寄生型和腐生型、浮游型和附着型细菌。海洋真菌的种类不超过500种，只有陆地真菌的1%。目前已知只有5种深海真菌生活在5315米深处。

通过显微镜，我们可以看到海洋细菌的特征。有三种类型：球形的被称为球菌，细长的被称为杆菌，弯曲的被称为螺旋。它们都是单细胞，内部结构与普通植物细胞相似。如果细菌在表面或合适的固体介质中生长繁殖到一定程度，就会形成可见的小菌落，称为菌落。菌落有不同的颜色，比如铜绿假单胞菌的菌落是绿色的，葡萄球菌的菌落是金黄色的。菌落的形状、大小和颜色是鉴定菌种的重要依据。

2. 海洋真菌

从进化的角度来看，海洋真菌比细菌晚出现大约10亿年，使它们成为微生物王国中最年轻的家族。真菌由多细胞细丝组成，产生孢子进行有性繁殖和无性繁殖。真菌与细菌和放线菌之间最根本的区别是它有一个真正的细胞核，所以真菌细胞也被称为真核细胞。原核细胞向真核细胞的发展是生物进化史上的一个重要事件。

大多数海洋真菌生活在某种基质上，只有少数真菌在没有基质的情况下自由生活。根据其栖息习性，海洋真菌可分为木本真菌、寄生藻真菌、红树林真菌、海草真菌和寄生生物真菌五种基本生态类型。

海洋真菌在海洋食物链中扮演着重要的角色。它们参与海洋有机物的分解和无机营养物质的再生，不断为海洋生物提供生命所需的物质。真菌体和酵母，特别是在海洋沉积物中，是许多海洋动物的食物来源。一些海洋真菌可以产生具有独特结构的抗菌剂和活性物质，在降解海洋污染物、促进海洋自净化等生态学和应用中发挥着重要作用。利用海洋真菌加工麦皮、甘蔗渣、秸秆等，可作为混合微生物碎屑用于水产养殖饲料。该方法具有可持续发展、高质量、低成本的优点。

3.病毒

海洋病毒是海洋生态系统的重要成员，具有形态和遗传多样性。海洋离海岸越近，海洋病毒的密度就越高。它在海洋真光层较多，但随着海深的增加逐渐减少，然后在接近海底时再次上升。

病毒感染海洋中的许多海洋生物。海洋噬菌体裂解死亡占异种细菌死亡率的60%。海洋蓝藻、真核生物和其他重要的海洋初级生产者也受到海洋病毒的影响。病毒也能分解某些种类的浮游动物。众所周知，病毒感染引起疾病，给养殖业带来了重大影响。研究表明，杆状病毒是引起该流行病的原因，该流行病自1993年以来在对虾养殖区广泛发生。除了破坏性的一面，海洋病毒也有好的一面。一些海洋病毒可以帮助某些海洋浮游植物生长，这对海洋环境和人类的生存都是有益的。海洋病毒在海洋生态系统中的作用日益引起人们的关注。