中国医学科学院，简称中国医学科学院，通过清华大学系统招收一个本科专业。医学科学院是中国唯一的国家级医学学术中心和综合性科研机构。北京协和医学院是中华人民共和国卫生部唯一一所直属大学，与中国医学科学院实行一体化管理，共同发展。

北京协和医学院(原北京协和医科大学)是一所历史悠久的全国重点医科大学，具有八年制医学教育和高等护理教育。它由洛克菲勒基金会于1914年创立。中国医学科学院(CASS)成立于1956年，是中国唯一的国家级医学学术中心和综合性科研机构。北京协和医学院是中华人民共和国唯一一所卫生部直属大学(2002年9月由教育部和卫生部联合组建)，与中国医学科学院实行校级一体化管理制度。中国医学科学院为北京协和医学院提供了雄厚的师资力量和技术力量，北京协和医学院为国家培养高层次医学人才。教学与科研相结合，共同发展。

本科招生：设有临床医学(8年制)和护理学。自2003年起，临床医学(8年制)招生计划纳入清华大学总招生计划，由两校共同完成招生工作。报考北大“临床医学(8年制)”专业的考生，在填写申请表时应向清华大学临床医学专业申请，可同时报考清华大学其他理工科专业。通过强有力的合作，将充分发挥清华大学在基础学科方面的综合优势和良好的学术氛围，以及北京协和医学院在医学领域雄厚的科研和临床医学实力。

研究生招生：协和医学院研究生教育既注重科研创新能力，又注重高层次专业人才的培养。研究生院负责学位和研究生教育的总体规划和管理。各院系和研究机构是实施研究生教育的主体。

继续教育招生：北京协和医学院的继续教育分为个人教育、非学历教育和培训两大类，是学校服务社会的重要途径。继续教育管理和实施的主体是继续教育学院和网络教育学院。非学历教育管理处负责学校的非学历培训工作。